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廣州貫善生物科技有限公司

主營:高通量測序,蛋白質組學,分子生物學
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[供應]微生物多樣性檢測
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  • 產品產地:廣東廣州
  • 產品品牌:貫善生物
  • 包裝規(guī)格:SATXAM2016
  • 產品數量:1000000
  • 計量單位:個
  • 產品單價:600
  • 更新日期:2016-06-13 08:54:01
  • 有效期至:2017-06-13
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微生物多樣性檢測 詳細信息

16S/18S/ITS 測序

 

    16S/18S/ITS rDNA,序列包含可變區(qū)(Variable region)和保守區(qū)(constant region)??勺儏^(qū)序列因細菌而異,且變異程度與細菌的系統(tǒng)發(fā)育密切相關,通過提取環(huán)境樣品的DNA,并擴增和檢測其中的一段或幾段區(qū)域,可以了解環(huán)境樣品中細菌的分類和豐度。

 

    一、技術流程

    二、生物信息分析內容

        1. 測序質量分析與統(tǒng)計、評估

        2. OTU列表生成及注釋(默認相似度0.97)

        3. 稀釋曲線、Alpha多樣性分析(默認相似度0.97)

        4. 物種豐度差異分析

        5. 聚類熱圖

        6. 單樣品、多樣品物種分布

        7. OTU比較Venn圖

        8. 含進化關系的物種分布

        9. Beta多樣性分析

 

    三、結果展示

        1. 數據庫使用

注釋數據庫

網頁鏈接

16S細菌和古菌

Greengene(greengenes.secondgenome/)

ITS

Unite(unite.ut.ee/index.phpRelease)

 

        2. 版圖展示

 

        圖1.1所示,多樣品結果構分析放在一起對比時,觀測樣本間的變化;

圖1.1 多樣本物種分布

 

    四、樣本要求

        DNA總量:〉200ng;濃度:〉20 ng/μL;260/280: 1.8~2.0

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