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    廣州貫善生物科技有限公司

    主營(yíng):高通量測(cè)序,蛋白質(zhì)組學(xué),分子生物學(xué)
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    [供應(yīng)]微生物多樣性檢測(cè)
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    • 產(chǎn)品產(chǎn)地:廣東廣州
    • 產(chǎn)品品牌:貫善生物
    • 包裝規(guī)格:SATXAM2016
    • 產(chǎn)品數(shù)量:1000000
    • 計(jì)量單位:個(gè)
    • 產(chǎn)品單價(jià):600
    • 更新日期:2016-06-13 08:54:01
    • 有效期至:2017-06-13
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    微生物多樣性檢測(cè) 詳細(xì)信息

    16S/18S/ITS 測(cè)序

     

        16S/18S/ITS rDNA,序列包含可變區(qū)(Variable region)和保守區(qū)(constant region)??勺儏^(qū)序列因細(xì)菌而異,且變異程度與細(xì)菌的系統(tǒng)發(fā)育密切相關(guān),通過提取環(huán)境樣品的DNA,并擴(kuò)增和檢測(cè)其中的一段或幾段區(qū)域,可以了解環(huán)境樣品中細(xì)菌的分類和豐度。

     

        一、技術(shù)流程

        二、生物信息分析內(nèi)容

            1. 測(cè)序質(zhì)量分析與統(tǒng)計(jì)、評(píng)估

            2. OTU列表生成及注釋(默認(rèn)相似度0.97)

            3. 稀釋曲線、Alpha多樣性分析(默認(rèn)相似度0.97)

            4. 物種豐度差異分析

            5. 聚類熱圖

            6. 單樣品、多樣品物種分布

            7. OTU比較Venn圖

            8. 含進(jìn)化關(guān)系的物種分布

            9. Beta多樣性分析

     

        三、結(jié)果展示

            1. 數(shù)據(jù)庫(kù)使用

    注釋數(shù)據(jù)庫(kù)

    網(wǎng)頁(yè)鏈接

    16S細(xì)菌和古菌

    Greengene(greengenes.secondgenome/)

    ITS

    Unite(unite.ut.ee/index.phpRelease)

     

            2. 版圖展示

     

            圖1.1所示,多樣品結(jié)果構(gòu)分析放在一起對(duì)比時(shí),觀測(cè)樣本間的變化;

    圖1.1 多樣本物種分布

     

        四、樣本要求

            DNA總量:〉200ng;濃度:〉20 ng/μL;260/280: 1.8~2.0

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