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[供應]宏基因組測序

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宏基因組測序詳細信息

宏基因組測序

宏基因組測序?qū)Νh(huán)境樣本所有微生物基因組DNA進行提取和高通量測序，分析樣本環(huán)境中所有微生物基因組信息。宏基因組測序解讀微生物群體的多樣性與豐度信息，分析微生物群體基因組及功能，也探求微生物與環(huán)境、微生物與宿主之間的關系，發(fā)掘和研究新的功能基因。

一、技術流程

二、生物信息分析內(nèi)容

1. 測序質(zhì)量分析與統(tǒng)計、評估

2.數(shù)據(jù)庫比對；

3. 物種豐度分析；

4. 功能基因注釋；

5. 基因功能豐度差異分析；

6. Pathway富集分析；

7.豐度差異基因/物種聚類分析

8. PCA分析

三、結果展示

1.數(shù)據(jù)庫使用

數(shù)據(jù)庫

網(wǎng)頁鏈接

NCBI NR

ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db

KEGG Pathway

kegg.jp

2.版圖展示

圖1.1所示，PCA分析有效展示樣本間的關系

圖1.1 PCA

四、樣本要求

總量：〉5 μg gDNA；濃度：〉100 ng/μL；260/280：〉1.8

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